La SEP se manifeste le plus souvent sous forme de poussées, définies comme l'apparition de nouveaux symptômes ou l'aggravation d'anciens symptômes, durant 24 heures au moins sans fièvre. Les poussées sont entrecoupées de périodes de rémission pendant lesquelles l'organisme se rétablit. Des années s'écoulent parfois entre deux poussées.
Les poussées apparaissent quand la gaine de myéline s'altère sous l'effet de réactions inflammatoires (démyélinisation).
Les périodes de rémission correspondent à une réparation naturelle (remyélinisation), totale ou partielle, de ces lésions.